测量前的美济礁在海图上仅仅是一个礁石符号。实地测量发现美济礁东西长约4.4海里，南北宽约3.5海里，环礁宽300~800米，整体近似椭圆，中部是一个长约4海里宽约2.5海里的泻湖。泻湖底部平坦，水深较深。泻湖南部有一个宽约90米天然开口，水深足够大型舰艇进入，泻湖内可供几十艘大中型舰船锚泊、集结、避风

测量期间遭遇台风，经总参作战部批准，我测量船只进入美济礁泻湖避风。当阵风10级时，五彩缤纷的礁盘外波涛汹涌，而泻湖内只是微波荡漾。来自海南、香港、广东、菲律宾的很多渔船也来此地避风，它们锚泊时与海军测量船通常保持一定距离。
1991年9月，南京海军指挥学院战役指挥班战略课教员布置了一篇关于海军战略的论文题。其中一位学员是南海测量参与者，结合前期工作实际，他根据进入美济礁泻湖避风的情景及美济礁自然形态和地理位置写了题为《谈美济礁在南沙海域的战略地位》的论文。
论文首先分析了我方在南沙群岛的军事态势，认为：
1、我方虽然初步实现了在南沙群岛的军事存在，但与周边菲、越、马等国相比，仍处于明显不利地位。所驻岛礁均偏于南沙群岛北部和西北部，岛礁之间被他国所占岛礁分割，未形成实际控制区，难以体现我对南沙群岛及其海域的全部主权；
2、已经入驻的6个岛礁均在越苏-22歼轰机作战半径之内，军事防御力极为脆弱；
3、离当时预测的南海油气产区距离很远，等等。

基于这些情况，要彻底改善南沙战略态势，必须在我国南沙群岛的无人岛礁中选择条件较好的礁盘建设南沙海域前进基地。
根据当初的勘察测量情况来看，美济礁位于南沙群岛中部稍微偏东位置，周围海域开阔，近距离内无敌占岛礁，可避开越作战飞机袭扰。如建起机场，从空中可俯瞰、掌控整个南沙群岛，与西沙永兴机场配合，可有效掌控整个南海制空权。美济礁中间泻湖可泊船避风，环礁上可建设各种军需民用设施。美济礁地理位置临近东亚、东北亚各国通过马六甲海峡前往大西洋印度洋的海上交通要道，建成后可大大改善我国在南沙的战略态势，总而言之，选择美济礁进驻最为理想。此外论文中还对可行性和建设步骤进行了分析和设想。

该论文交付后立即引起学院教授重视，认为涉及国家政治、军事发展战略和海军发展战略，应当上报。随后经海军出版社根据实测资料制作附图后，海军航保部以“批阅件”形式将该论文上报给了海军首长，随后上报至总参和中央军委。
但是当时正值全军精简整编时期，进驻美济礁的报告很长时间没有得到回应。
考虑到编制问题，海军随后又以“拟放弃进驻安达礁，尽快进驻美济礁”的意见上报军委。但由于当时南海周边各国不断对我外交发难，且国内外大环境因素影响，为创造良好国际环境，改善同世界各国的外交关系……嗯，等等，海军第二次进驻美济礁的报告又没有得到回应。

1993年国家海洋局的一次会议上与会者谈及了美济礁的相关情况，国家海洋局海洋战略研究所副所长杨金森与上述论文作者交流之后对此非常感兴趣，并建议以国家海洋局的名义报国务院批准。于是论文复印件及附图被转交给杨金森副所长。
当时国家海洋局惯例是每年下半年都要向国务院上报几件第二年应办的大事。在研究1994年应办大事时，海洋局领导一致认为：尽快进驻美济礁，是维护我国海洋权益的第一件大事。
为引起国务院领导及中央领导的重视，以前海洋局每年都要报两三件事，但今年决定只报进驻美济礁这一件事。

1994年中，国务院、中央军委终于批准了海军、国家海洋局进驻南沙群岛美济礁的建议。随后国家各部门进行了协调准备工作。同年，海军正式启动美济礁建设工程。991舰、927舰、南标463船（渔政21）、东标263船、南运835船等参加了任务。至1995年1月底，我国在美济礁共建了4个建筑群和13座第二代高脚屋，具备了基本的防守能力。

菲政府对此反应特别强烈，先后派出舰机进行侦察、驱赶和冲撞我方在附近海域捕鱼的渔船，扣押了我国62名渔民，并组织其本国和外国记者到美济礁附近进行所谓的“采访”，企图引起国际上的关注。越也对我国进驻美济礁提出了抗议。