兵马大元帅宋江（总司令）、兵马副元帅卢俊义（副总司令）
军机处（总参谋部）
正军师吴用（总参谋长）、副军师公孙胜（副总参谋长）、军师参赞朱武（作战部长）、秘书郎萧让（办公厅主任）
内史府（总后勤部）
大统领柴进（总后勤部长）、大总管李应（政治部主任）、侍郎蒋敬（财务部主任）
医政司：医疗使安道全（卫生部主任）
马政司：医马使皇甫瑞（车船部主任）
马军五虎将（装甲师上将，师长）
左军大将关胜、右军大将林冲、先锋大将秦明、合后大将呼延灼、虎军大将董平
马军八虎骑（装甲师中将，旅长）
龙骧大将军花荣、虎翼大将军徐宁、车骑大将军杨志、骠骑大将军索超、征南大将军朱仝、征东大将军张清、征西大将军史进、征北大将军穆弘
马军小彪将（装甲师少将，营长）
龙骧营：统领孙立
虎翼营：统领黄信、宣赞、郝思文
哨探营：统领韩滔
飞骑营：统领彭玘
圣水营：统领单廷圭
神火营：统领魏定国
长弓营：统领邓飞
飞虎营：统领燕顺
飞豹营：统领杨林
右翼营：统领欧鹏
后援营：统领马麟
左翼营：统领周通
先锋营：统领陈达、杨春
步军（步兵师）
总大将鲁智深、副大将武松（步兵师上将）
冲击营：统领刘唐（步兵师中将）
突击营：统领雷横（步兵师中将）
游击营：统领石秀（步兵师中将）、头领邹润、邹渊（步兵师少将）
阻击营：统领解珍、解宝（步兵师中将）
横冲营：统领项充、李衮、李忠（步兵师少将）
长枪营：统领郑天寿、薛永（步兵师少将）
山地营：统领焦挺（步兵师少将）
奇袭营：统领龚旺、丁得孙（步兵师少将）
巡逻营：统领施恩（步兵师少将）
搜捕营：统领石勇（步兵师少将）
前锋营：统领穆春（步兵师少将）
左翼营：统领宋万（步兵师少将）
右翼营：统领杜迁（步兵师少将）
后援营：统领杨雄（步兵师少将）
中军（卫戍师）
都统李逵（卫戍师上将）
马军护卫队：统领吕方、郭盛（卫戍师少将）
步兵护卫队：统领孔明、孔亮（卫戍师少将）
内营护卫队：统领王英（卫戍师少将）
内营娘子军：统领扈三娘（女兵少将）
帅旗营：掌旗使郁保四（卫戍师少将）
水军（海军）
都统李俊（海军上将）
楼船营：统领阮小二（海军中将）
炮艇营：统领张横（海军中将）
弩船营：统领阮小五（海军中将）
水鬼营：统领张顺（海军中将）
快艇营：统领阮小七（海军中将）
水雷营：统领童威（海军少将）
火船营：统领童猛（海军少将）
特攻军（特种部队）
火炮营：统领凌振（特种兵少将）
装甲重剑营：统领鲍旭（特种兵少将）
魔法营：统领樊瑞（特种兵少将）
机密情报营（情报局）
都统戴宗（情报局长）、副都统燕青（副局长）
头领乐和、白胜、时迁、段景住（下属各单位主任）
赏罚监（宪兵队）
总管裴宣
行刑司：头领蔡福、蔡庆
礼宾监（军需部）
总管宋清
酿造司：监造使朱富
太宰司：太宰使曹正
迎宾司：南山迎宾使杜兴、朱贵
北山迎宾使李立、王定六
东山迎宾使孙新、顾大嫂
西山迎宾使张青、孙二娘
将作监（军械部）
总管柴进（兼）
印信司：监造使金大坚
战船司：监造使孟康
旌服司：监造使侯健
兵器司：监造使汤隆
火炮司：监造使凌振（兼）
城垣司：监造使陶宗旺
修葺司：监造使李云
注：
正一品：兵马大元帅
从一品：兵马副元帅
正二品：正军师、内务府大总领、马军五虎将、步军大将
从二品：副军师、内务府大总管、步军副将、都统
正三品：龙骧大将军、虎翼大将军、车骑大将军、骠骑大将军、副都统
从三品：征南大将军、征东大将军、征西大将军、征北大将军
正四品：军师参赞、统领、总管
从四品：秘书郎、侍郎、头领、司使