杨增新遇刺身亡之后，金树仁办理了后事。1929年春，杨增新的灵柩沿着西伯利亚铁路运回北京，安葬在北京昌平沙河边上。这个安排，与杨增新的生前设想是有出入的。杨增新曾对众人说：死后埋在天池，永不离开新疆。
杨增新生前遗嘱：葬在天池
杨增新遇难的前一年，他致函北京的堂弟：“做官之苦，苦于黄连；做官之难，难于登天；做官之险，险于投河跳井。我历练数十年，知之甚深。在新疆支持十余年，谈何容易！家中子弟依草附木，无一人能自立，都想来新疆发财，却不知我如同活在地狱中，日日想跳出来而不能。
杨增新给侄子的书信中诉苦，说他已经年迈，但仍有两件遗憾的事。“其一，新疆之事，无一好人可以托付；其二，两个儿子年幼，家事不能托付……看来我非苦死新疆不可。”杨增新打电报给北京的女儿，预言结局：“出了玉门关icon，死又不知何处。我当忠于新疆，终于新疆