中国进行动物区系分区的原则主要包括以下几个方面：地理位置原则：按照地理位置的远近分区，比如以长江为分界线，将中国分为南北两个区域。气候环境原则：按照气候、地形、海拔等自然条件的不同分区，比如将中国分为北方草原区、南方亚热带雨林区等。生态系统原则：按照生态系统的类型和地理区域的不同进行分区，比如以高山生态、湿地生态、海洋生态等为划分依据。动植物区系原则：按照动植物的分布范围、数量、种类等特征进行分区，比如以珍稀濒危物种的分布情况为划分依据。经济发展原则：按照经济发展水平和人口分布情况进行分区，比如以东部沿海地区、中部地区、西部地区等为划分依据。