蘑菇云游戏支持多种手柄，包括Xbox One手柄、PS4手柄、Switch Pro手柄、Steam手柄、MOGA手柄、SteelSeries手柄等等。同时，蘑菇云游戏也支持通过OTG线连接手机的普通手柄，如Logitech F310、F710、F510等。